Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms