Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms