Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S4

Rexo2, Oligoribonuclease, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo2Q9D8S4 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rexo2Q9D8S4 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rexo2Q9D8S4 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rexo2Q9D8S4 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rexo2Q9D8S4 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rexo2Q9D8S4 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rexo2Q9D8S4 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rexo2Q9D8S4 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rexo2Q9D8S4 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rexo2Q9D8S4 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rexo2Q9D8S4 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rexo2Q9D8S4 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rexo2Q9D8S4 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rexo2Q9D8S4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rexo2Q9D8S4 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rexo2Q9D8S4 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rexo2Q9D8S4 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rexo2Q9D8S4 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rexo2Q9D8S4 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rexo2Q9D8S4 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rexo2Q9D8S4 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rexo2Q9D8S4 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rexo2Q9D8S4 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rexo2Q9D8S4 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rexo2Q9D8S4 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rexo2Q9D8S4 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rexo2Q9D8S4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rexo2Q9D8S4 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rexo2Q9D8S4 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rexo2Q9D8S4 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rexo2Q9D8S4 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rexo2Q9D8S4 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rexo2Q9D8S4 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rexo2Q9D8S4 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rexo2Q9D8S4 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rexo2Q9D8S4 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rexo2Q9D8S4 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rexo2Q9D8S4 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rexo2Q9D8S4 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rexo2Q9D8S4 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rexo2Q9D8S4 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rexo2Q9D8S4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rexo2Q9D8S4 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rexo2Q9D8S4 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rexo2Q9D8S4 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rexo2Q9D8S4 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rexo2Q9D8S4 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rexo2Q9D8S4 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rexo2Q9D8S4 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rexo2Q9D8S4 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rexo2Q9D8S4 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rexo2Q9D8S4 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rexo2Q9D8S4 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rexo2Q9D8S4 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rexo2Q9D8S4 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rexo2Q9D8S4 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rexo2Q9D8S4 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rexo2Q9D8S4 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rexo2Q9D8S4 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rexo2Q9D8S4 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rexo2Q9D8S4 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rexo2Q9D8S4 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rexo2Q9D8S4 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rexo2Q9D8S4 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rexo2Q9D8S4 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rexo2Q9D8S4 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rexo2Q9D8S4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rexo2Q9D8S4 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rexo2Q9D8S4 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rexo2Q9D8S4 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rexo2Q9D8S4 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rexo2Q9D8S4 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rexo2Q9D8S4 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rexo2Q9D8S4 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rexo2Q9D8S4 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rexo2Q9D8S4 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rexo2Q9D8S4 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rexo2Q9D8S4 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rexo2Q9D8S4 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rexo2Q9D8S4 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rexo2Q9D8S4 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rexo2Q9D8S4 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rexo2Q9D8S4 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rexo2Q9D8S4 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rexo2Q9D8S4 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rexo2Q9D8S4 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rexo2Q9D8S4 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rexo2Q9D8S4 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rexo2Q9D8S4 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rexo2Q9D8S4 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rexo2Q9D8S4 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rexo2Q9D8S4 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rexo2Q9D8S4 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rexo2Q9D8S4 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rexo2Q9D8S4 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rexo2Q9D8S4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rexo2Q9D8S4 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rexo2Q9D8S4 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rexo2Q9D8S4 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rexo2Q9D8S4 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms