Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F3

Slc52a2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc52a2Q9D8F3 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc52a2Q9D8F3 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc52a2Q9D8F3 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc52a2Q9D8F3 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc52a2Q9D8F3 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc52a2Q9D8F3 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc52a2Q9D8F3 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc52a2Q9D8F3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc52a2Q9D8F3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc52a2Q9D8F3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc52a2Q9D8F3 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc52a2Q9D8F3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc52a2Q9D8F3 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc52a2Q9D8F3 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc52a2Q9D8F3 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc52a2Q9D8F3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc52a2Q9D8F3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc52a2Q9D8F3 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc52a2Q9D8F3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc52a2Q9D8F3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc52a2Q9D8F3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc52a2Q9D8F3 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc52a2Q9D8F3 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc52a2Q9D8F3 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc52a2Q9D8F3 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc52a2Q9D8F3 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc52a2Q9D8F3 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc52a2Q9D8F3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc52a2Q9D8F3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc52a2Q9D8F3 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc52a2Q9D8F3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc52a2Q9D8F3 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc52a2Q9D8F3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc52a2Q9D8F3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc52a2Q9D8F3 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc52a2Q9D8F3 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc52a2Q9D8F3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc52a2Q9D8F3 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc52a2Q9D8F3 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc52a2Q9D8F3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc52a2Q9D8F3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc52a2Q9D8F3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc52a2Q9D8F3 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc52a2Q9D8F3 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc52a2Q9D8F3 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc52a2Q9D8F3 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc52a2Q9D8F3 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc52a2Q9D8F3 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc52a2Q9D8F3 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc52a2Q9D8F3 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc52a2Q9D8F3 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc52a2Q9D8F3 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc52a2Q9D8F3 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc52a2Q9D8F3 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc52a2Q9D8F3 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc52a2Q9D8F3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc52a2Q9D8F3 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc52a2Q9D8F3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc52a2Q9D8F3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc52a2Q9D8F3 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc52a2Q9D8F3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc52a2Q9D8F3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc52a2Q9D8F3 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc52a2Q9D8F3 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc52a2Q9D8F3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc52a2Q9D8F3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc52a2Q9D8F3 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc52a2Q9D8F3 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc52a2Q9D8F3 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc52a2Q9D8F3 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc52a2Q9D8F3 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc52a2Q9D8F3 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc52a2Q9D8F3 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc52a2Q9D8F3 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc52a2Q9D8F3 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc52a2Q9D8F3 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc52a2Q9D8F3 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc52a2Q9D8F3 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc52a2Q9D8F3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc52a2Q9D8F3 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc52a2Q9D8F3 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc52a2Q9D8F3 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc52a2Q9D8F3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc52a2Q9D8F3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc52a2Q9D8F3 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc52a2Q9D8F3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc52a2Q9D8F3 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Slc52a2Q9D8F3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Slc52a2Q9D8F3 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Slc52a2Q9D8F3 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Slc52a2Q9D8F3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc52a2Q9D8F3 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc52a2Q9D8F3 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc52a2Q9D8F3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc52a2Q9D8F3 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc52a2Q9D8F3 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc52a2Q9D8F3 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc52a2Q9D8F3 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc52a2Q9D8F3 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc52a2Q9D8F3 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms