Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms