Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capns2Q9D7J7 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capns2Q9D7J7 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capns2Q9D7J7 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Capns2Q9D7J7 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Capns2Q9D7J7 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capns2Q9D7J7 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capns2Q9D7J7 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capns2Q9D7J7 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capns2Q9D7J7 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capns2Q9D7J7 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Capns2Q9D7J7 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capns2Q9D7J7 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capns2Q9D7J7 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Capns2Q9D7J7 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Capns2Q9D7J7 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capns2Q9D7J7 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capns2Q9D7J7 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capns2Q9D7J7 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capns2Q9D7J7 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capns2Q9D7J7 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capns2Q9D7J7 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capns2Q9D7J7 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capns2Q9D7J7 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capns2Q9D7J7 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capns2Q9D7J7 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capns2Q9D7J7 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capns2Q9D7J7 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capns2Q9D7J7 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capns2Q9D7J7 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capns2Q9D7J7 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capns2Q9D7J7 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capns2Q9D7J7 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capns2Q9D7J7 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capns2Q9D7J7 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capns2Q9D7J7 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capns2Q9D7J7 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capns2Q9D7J7 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capns2Q9D7J7 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capns2Q9D7J7 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capns2Q9D7J7 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capns2Q9D7J7 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capns2Q9D7J7 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capns2Q9D7J7 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Capns2Q9D7J7 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capns2Q9D7J7 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capns2Q9D7J7 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capns2Q9D7J7 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capns2Q9D7J7 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capns2Q9D7J7 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capns2Q9D7J7 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capns2Q9D7J7 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capns2Q9D7J7 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capns2Q9D7J7 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capns2Q9D7J7 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capns2Q9D7J7 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capns2Q9D7J7 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capns2Q9D7J7 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capns2Q9D7J7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capns2Q9D7J7 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Capns2Q9D7J7 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Capns2Q9D7J7 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capns2Q9D7J7 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capns2Q9D7J7 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capns2Q9D7J7 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capns2Q9D7J7 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Capns2Q9D7J7 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capns2Q9D7J7 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capns2Q9D7J7 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capns2Q9D7J7 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capns2Q9D7J7 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capns2Q9D7J7 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capns2Q9D7J7 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capns2Q9D7J7 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capns2Q9D7J7 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capns2Q9D7J7 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capns2Q9D7J7 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capns2Q9D7J7 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capns2Q9D7J7 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capns2Q9D7J7 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capns2Q9D7J7 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capns2Q9D7J7 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capns2Q9D7J7 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capns2Q9D7J7 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capns2Q9D7J7 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capns2Q9D7J7 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capns2Q9D7J7 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capns2Q9D7J7 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capns2Q9D7J7 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Capns2Q9D7J7 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capns2Q9D7J7 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capns2Q9D7J7 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capns2Q9D7J7 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capns2Q9D7J7 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capns2Q9D7J7 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capns2Q9D7J7 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capns2Q9D7J7 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capns2Q9D7J7 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Capns2Q9D7J7 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capns2Q9D7J7 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms