Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I0

Rtl8c, Cxx1c protein, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl8cQ9D6I0 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rtl8cQ9D6I0 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rtl8cQ9D6I0 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rtl8cQ9D6I0 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rtl8cQ9D6I0 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rtl8cQ9D6I0 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rtl8cQ9D6I0 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rtl8cQ9D6I0 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rtl8cQ9D6I0 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rtl8cQ9D6I0 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rtl8cQ9D6I0 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rtl8cQ9D6I0 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rtl8cQ9D6I0 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rtl8cQ9D6I0 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rtl8cQ9D6I0 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rtl8cQ9D6I0 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rtl8cQ9D6I0 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rtl8cQ9D6I0 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rtl8cQ9D6I0 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rtl8cQ9D6I0 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rtl8cQ9D6I0 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rtl8cQ9D6I0 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rtl8cQ9D6I0 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rtl8cQ9D6I0 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rtl8cQ9D6I0 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rtl8cQ9D6I0 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rtl8cQ9D6I0 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rtl8cQ9D6I0 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rtl8cQ9D6I0 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rtl8cQ9D6I0 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rtl8cQ9D6I0 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rtl8cQ9D6I0 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rtl8cQ9D6I0 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rtl8cQ9D6I0 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rtl8cQ9D6I0 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rtl8cQ9D6I0 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rtl8cQ9D6I0 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rtl8cQ9D6I0 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rtl8cQ9D6I0 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rtl8cQ9D6I0 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rtl8cQ9D6I0 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rtl8cQ9D6I0 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rtl8cQ9D6I0 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rtl8cQ9D6I0 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rtl8cQ9D6I0 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rtl8cQ9D6I0 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rtl8cQ9D6I0 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rtl8cQ9D6I0 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rtl8cQ9D6I0 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rtl8cQ9D6I0 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rtl8cQ9D6I0 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rtl8cQ9D6I0 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rtl8cQ9D6I0 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rtl8cQ9D6I0 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rtl8cQ9D6I0 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rtl8cQ9D6I0 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rtl8cQ9D6I0 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rtl8cQ9D6I0 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rtl8cQ9D6I0 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rtl8cQ9D6I0 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rtl8cQ9D6I0 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rtl8cQ9D6I0 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rtl8cQ9D6I0 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rtl8cQ9D6I0 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rtl8cQ9D6I0 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rtl8cQ9D6I0 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rtl8cQ9D6I0 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rtl8cQ9D6I0 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rtl8cQ9D6I0 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rtl8cQ9D6I0 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rtl8cQ9D6I0 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rtl8cQ9D6I0 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rtl8cQ9D6I0 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rtl8cQ9D6I0 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rtl8cQ9D6I0 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rtl8cQ9D6I0 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rtl8cQ9D6I0 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rtl8cQ9D6I0 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rtl8cQ9D6I0 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rtl8cQ9D6I0 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rtl8cQ9D6I0 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rtl8cQ9D6I0 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms