Protein–RNA interactions for Protein: Q9D572

Ubxn11, UBX domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn11Q9D572 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
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