Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms