Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rufy3Q9D394 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rufy3Q9D394 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rufy3Q9D394 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rufy3Q9D394 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rufy3Q9D394 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rufy3Q9D394 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rufy3Q9D394 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rufy3Q9D394 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rufy3Q9D394 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rufy3Q9D394 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rufy3Q9D394 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rufy3Q9D394 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Rufy3Q9D394 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rufy3Q9D394 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rufy3Q9D394 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rufy3Q9D394 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rufy3Q9D394 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rufy3Q9D394 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rufy3Q9D394 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rufy3Q9D394 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rufy3Q9D394 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rufy3Q9D394 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rufy3Q9D394 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rufy3Q9D394 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rufy3Q9D394 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rufy3Q9D394 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rufy3Q9D394 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rufy3Q9D394 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Rufy3Q9D394 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rufy3Q9D394 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rufy3Q9D394 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rufy3Q9D394 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rufy3Q9D394 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rufy3Q9D394 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Rufy3Q9D394 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rufy3Q9D394 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Rufy3Q9D394 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rufy3Q9D394 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rufy3Q9D394 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rufy3Q9D394 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rufy3Q9D394 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rufy3Q9D394 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rufy3Q9D394 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rufy3Q9D394 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rufy3Q9D394 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms