Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D2Q3 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D2Q3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D2Q3 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D2Q3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D2Q3 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D2Q3 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D2Q3 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D2Q3 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D2Q3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D2Q3 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D2Q3 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D2Q3 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D2Q3 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D2Q3 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D2Q3 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D2Q3 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D2Q3 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D2Q3 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D2Q3 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D2Q3 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D2Q3 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D2Q3 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D2Q3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D2Q3 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D2Q3 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D2Q3 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D2Q3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D2Q3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D2Q3 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D2Q3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D2Q3 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D2Q3 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D2Q3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D2Q3 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D2Q3 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D2Q3 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D2Q3 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D2Q3 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D2Q3 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D2Q3 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D2Q3 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D2Q3 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D2Q3 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D2Q3 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D2Q3 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D2Q3 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D2Q3 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D2Q3 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D2Q3 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D2Q3 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D2Q3 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D2Q3 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D2Q3 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D2Q3 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D2Q3 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D2Q3 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D2Q3 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D2Q3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D2Q3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D2Q3 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D2Q3 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D2Q3 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D2Q3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D2Q3 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D2Q3 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D2Q3 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D2Q3 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D2Q3 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D2Q3 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D2Q3 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D2Q3 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D2Q3 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D2Q3 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D2Q3 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D2Q3 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D2Q3 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D2Q3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D2Q3 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D2Q3 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D2Q3 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D2Q3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D2Q3 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D2Q3 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D2Q3 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D2Q3 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D2Q3 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D2Q3 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D2Q3 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D2Q3 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D2Q3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D2Q3 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D2Q3 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D2Q3 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D2Q3 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D2Q3 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D2Q3 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D2Q3 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D2Q3 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D2Q3 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms