Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms