Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZH8

Ccdc77, Coiled-coil domain-containing protein 77, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc77Q9CZH8 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc77Q9CZH8 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc77Q9CZH8 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc77Q9CZH8 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc77Q9CZH8 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc77Q9CZH8 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc77Q9CZH8 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc77Q9CZH8 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc77Q9CZH8 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc77Q9CZH8 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc77Q9CZH8 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc77Q9CZH8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc77Q9CZH8 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc77Q9CZH8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc77Q9CZH8 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc77Q9CZH8 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc77Q9CZH8 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc77Q9CZH8 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc77Q9CZH8 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc77Q9CZH8 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc77Q9CZH8 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc77Q9CZH8 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc77Q9CZH8 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc77Q9CZH8 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc77Q9CZH8 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc77Q9CZH8 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc77Q9CZH8 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc77Q9CZH8 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc77Q9CZH8 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc77Q9CZH8 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc77Q9CZH8 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc77Q9CZH8 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc77Q9CZH8 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc77Q9CZH8 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc77Q9CZH8 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc77Q9CZH8 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc77Q9CZH8 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc77Q9CZH8 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc77Q9CZH8 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc77Q9CZH8 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc77Q9CZH8 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc77Q9CZH8 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc77Q9CZH8 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc77Q9CZH8 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc77Q9CZH8 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc77Q9CZH8 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc77Q9CZH8 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc77Q9CZH8 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc77Q9CZH8 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc77Q9CZH8 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc77Q9CZH8 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc77Q9CZH8 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc77Q9CZH8 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc77Q9CZH8 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc77Q9CZH8 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc77Q9CZH8 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc77Q9CZH8 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc77Q9CZH8 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc77Q9CZH8 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc77Q9CZH8 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc77Q9CZH8 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc77Q9CZH8 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc77Q9CZH8 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc77Q9CZH8 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc77Q9CZH8 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc77Q9CZH8 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc77Q9CZH8 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc77Q9CZH8 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc77Q9CZH8 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc77Q9CZH8 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc77Q9CZH8 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc77Q9CZH8 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc77Q9CZH8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc77Q9CZH8 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc77Q9CZH8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc77Q9CZH8 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc77Q9CZH8 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc77Q9CZH8 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc77Q9CZH8 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc77Q9CZH8 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc77Q9CZH8 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc77Q9CZH8 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc77Q9CZH8 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc77Q9CZH8 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc77Q9CZH8 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc77Q9CZH8 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc77Q9CZH8 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc77Q9CZH8 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc77Q9CZH8 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc77Q9CZH8 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc77Q9CZH8 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc77Q9CZH8 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc77Q9CZH8 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc77Q9CZH8 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc77Q9CZH8 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc77Q9CZH8 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc77Q9CZH8 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc77Q9CZH8 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc77Q9CZH8 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc77Q9CZH8 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms