Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cxxc1Q9CWW7 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms