Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU4

UPF0690 protein C1orf52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CWU4 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9CWU4 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9CWU4 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9CWU4 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9CWU4 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9CWU4 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9CWU4 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9CWU4 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9CWU4 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9CWU4 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9CWU4 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9CWU4 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9CWU4 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9CWU4 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9CWU4 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9CWU4 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9CWU4 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9CWU4 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9CWU4 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9CWU4 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9CWU4 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9CWU4 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9CWU4 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9CWU4 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9CWU4 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9CWU4 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9CWU4 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9CWU4 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9CWU4 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9CWU4 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9CWU4 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9CWU4 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9CWU4 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9CWU4 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9CWU4 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9CWU4 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9CWU4 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9CWU4 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9CWU4 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9CWU4 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9CWU4 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9CWU4 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9CWU4 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9CWU4 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9CWU4 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9CWU4 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9CWU4 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9CWU4 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9CWU4 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9CWU4 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9CWU4 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9CWU4 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9CWU4 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9CWU4 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q9CWU4 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q9CWU4 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q9CWU4 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q9CWU4 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q9CWU4 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q9CWU4 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q9CWU4 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q9CWU4 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q9CWU4 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q9CWU4 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q9CWU4 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q9CWU4 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q9CWU4 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9CWU4 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9CWU4 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9CWU4 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9CWU4 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9CWU4 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9CWU4 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9CWU4 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9CWU4 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9CWU4 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9CWU4 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9CWU4 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9CWU4 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9CWU4 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9CWU4 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9CWU4 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9CWU4 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9CWU4 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9CWU4 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9CWU4 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9CWU4 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CWU4 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CWU4 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CWU4 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CWU4 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CWU4 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CWU4 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CWU4 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CWU4 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CWU4 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CWU4 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CWU4 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CWU4 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CWU4 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms