Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sycp2Q9CUU3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sycp2Q9CUU3 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Sycp2Q9CUU3 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Sycp2Q9CUU3 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sycp2Q9CUU3 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Sycp2Q9CUU3 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sycp2Q9CUU3 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sycp2Q9CUU3 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sycp2Q9CUU3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sycp2Q9CUU3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sycp2Q9CUU3 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Sycp2Q9CUU3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sycp2Q9CUU3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sycp2Q9CUU3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sycp2Q9CUU3 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Sycp2Q9CUU3 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Sycp2Q9CUU3 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sycp2Q9CUU3 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Sycp2Q9CUU3 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sycp2Q9CUU3 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sycp2Q9CUU3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Sycp2Q9CUU3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sycp2Q9CUU3 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Sycp2Q9CUU3 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sycp2Q9CUU3 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Sycp2Q9CUU3 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Sycp2Q9CUU3 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sycp2Q9CUU3 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Sycp2Q9CUU3 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Sycp2Q9CUU3 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sycp2Q9CUU3 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Sycp2Q9CUU3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Sycp2Q9CUU3 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sycp2Q9CUU3 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sycp2Q9CUU3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sycp2Q9CUU3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sycp2Q9CUU3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sycp2Q9CUU3 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sycp2Q9CUU3 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sycp2Q9CUU3 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sycp2Q9CUU3 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sycp2Q9CUU3 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sycp2Q9CUU3 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sycp2Q9CUU3 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sycp2Q9CUU3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sycp2Q9CUU3 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sycp2Q9CUU3 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Sycp2Q9CUU3 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Sycp2Q9CUU3 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sycp2Q9CUU3 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sycp2Q9CUU3 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Sycp2Q9CUU3 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sycp2Q9CUU3 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Sycp2Q9CUU3 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sycp2Q9CUU3 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sycp2Q9CUU3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sycp2Q9CUU3 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sycp2Q9CUU3 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sycp2Q9CUU3 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sycp2Q9CUU3 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sycp2Q9CUU3 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sycp2Q9CUU3 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sycp2Q9CUU3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sycp2Q9CUU3 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sycp2Q9CUU3 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sycp2Q9CUU3 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sycp2Q9CUU3 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sycp2Q9CUU3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sycp2Q9CUU3 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sycp2Q9CUU3 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Sycp2Q9CUU3 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sycp2Q9CUU3 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sycp2Q9CUU3 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sycp2Q9CUU3 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Sycp2Q9CUU3 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sycp2Q9CUU3 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sycp2Q9CUU3 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sycp2Q9CUU3 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sycp2Q9CUU3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sycp2Q9CUU3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sycp2Q9CUU3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sycp2Q9CUU3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sycp2Q9CUU3 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sycp2Q9CUU3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sycp2Q9CUU3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sycp2Q9CUU3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sycp2Q9CUU3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sycp2Q9CUU3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sycp2Q9CUU3 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sycp2Q9CUU3 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sycp2Q9CUU3 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sycp2Q9CUU3 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sycp2Q9CUU3 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sycp2Q9CUU3 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sycp2Q9CUU3 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sycp2Q9CUU3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sycp2Q9CUU3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sycp2Q9CUU3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Sycp2Q9CUU3 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72 ms