Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Fcf1Q9CTH6 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Fcf1Q9CTH6 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Fcf1Q9CTH6 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Fcf1Q9CTH6 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Fcf1Q9CTH6 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Fcf1Q9CTH6 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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