Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSV6

Sft2d3, Vesicle transport protein SFT2C, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d3Q9CSV6 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sft2d3Q9CSV6 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sft2d3Q9CSV6 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sft2d3Q9CSV6 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sft2d3Q9CSV6 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sft2d3Q9CSV6 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sft2d3Q9CSV6 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Sft2d3Q9CSV6 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sft2d3Q9CSV6 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sft2d3Q9CSV6 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sft2d3Q9CSV6 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sft2d3Q9CSV6 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sft2d3Q9CSV6 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sft2d3Q9CSV6 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sft2d3Q9CSV6 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sft2d3Q9CSV6 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sft2d3Q9CSV6 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Sft2d3Q9CSV6 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Sft2d3Q9CSV6 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sft2d3Q9CSV6 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sft2d3Q9CSV6 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sft2d3Q9CSV6 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sft2d3Q9CSV6 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sft2d3Q9CSV6 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sft2d3Q9CSV6 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sft2d3Q9CSV6 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sft2d3Q9CSV6 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sft2d3Q9CSV6 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sft2d3Q9CSV6 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sft2d3Q9CSV6 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sft2d3Q9CSV6 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sft2d3Q9CSV6 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sft2d3Q9CSV6 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sft2d3Q9CSV6 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sft2d3Q9CSV6 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sft2d3Q9CSV6 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sft2d3Q9CSV6 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sft2d3Q9CSV6 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Sft2d3Q9CSV6 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Sft2d3Q9CSV6 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Sft2d3Q9CSV6 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Sft2d3Q9CSV6 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Sft2d3Q9CSV6 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Sft2d3Q9CSV6 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sft2d3Q9CSV6 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sft2d3Q9CSV6 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sft2d3Q9CSV6 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sft2d3Q9CSV6 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sft2d3Q9CSV6 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sft2d3Q9CSV6 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sft2d3Q9CSV6 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sft2d3Q9CSV6 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sft2d3Q9CSV6 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sft2d3Q9CSV6 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Sft2d3Q9CSV6 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Sft2d3Q9CSV6 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Sft2d3Q9CSV6 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Sft2d3Q9CSV6 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sft2d3Q9CSV6 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sft2d3Q9CSV6 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sft2d3Q9CSV6 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sft2d3Q9CSV6 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sft2d3Q9CSV6 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sft2d3Q9CSV6 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sft2d3Q9CSV6 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sft2d3Q9CSV6 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sft2d3Q9CSV6 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sft2d3Q9CSV6 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sft2d3Q9CSV6 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sft2d3Q9CSV6 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sft2d3Q9CSV6 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sft2d3Q9CSV6 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sft2d3Q9CSV6 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sft2d3Q9CSV6 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sft2d3Q9CSV6 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sft2d3Q9CSV6 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sft2d3Q9CSV6 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sft2d3Q9CSV6 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sft2d3Q9CSV6 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sft2d3Q9CSV6 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sft2d3Q9CSV6 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sft2d3Q9CSV6 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sft2d3Q9CSV6 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sft2d3Q9CSV6 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sft2d3Q9CSV6 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sft2d3Q9CSV6 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sft2d3Q9CSV6 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sft2d3Q9CSV6 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sft2d3Q9CSV6 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sft2d3Q9CSV6 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sft2d3Q9CSV6 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Sft2d3Q9CSV6 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sft2d3Q9CSV6 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sft2d3Q9CSV6 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sft2d3Q9CSV6 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Sft2d3Q9CSV6 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sft2d3Q9CSV6 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sft2d3Q9CSV6 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sft2d3Q9CSV6 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sft2d3Q9CSV6 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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