Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

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Length 141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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PompQ9CQT5 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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PompQ9CQT5 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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