Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim8Q9CQQ0 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms