Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL6

Mrpl35, 39S ribosomal protein L35, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl35Q9CQL6 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl35Q9CQL6 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl35Q9CQL6 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl35Q9CQL6 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl35Q9CQL6 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl35Q9CQL6 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl35Q9CQL6 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl35Q9CQL6 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl35Q9CQL6 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl35Q9CQL6 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl35Q9CQL6 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl35Q9CQL6 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl35Q9CQL6 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl35Q9CQL6 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl35Q9CQL6 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl35Q9CQL6 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl35Q9CQL6 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl35Q9CQL6 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl35Q9CQL6 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl35Q9CQL6 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl35Q9CQL6 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl35Q9CQL6 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl35Q9CQL6 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl35Q9CQL6 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl35Q9CQL6 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl35Q9CQL6 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl35Q9CQL6 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl35Q9CQL6 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mrpl35Q9CQL6 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mrpl35Q9CQL6 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mrpl35Q9CQL6 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Mrpl35Q9CQL6 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mrpl35Q9CQL6 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mrpl35Q9CQL6 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mrpl35Q9CQL6 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mrpl35Q9CQL6 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mrpl35Q9CQL6 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mrpl35Q9CQL6 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mrpl35Q9CQL6 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mrpl35Q9CQL6 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mrpl35Q9CQL6 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mrpl35Q9CQL6 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mrpl35Q9CQL6 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mrpl35Q9CQL6 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mrpl35Q9CQL6 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mrpl35Q9CQL6 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Mrpl35Q9CQL6 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mrpl35Q9CQL6 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mrpl35Q9CQL6 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Mrpl35Q9CQL6 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Mrpl35Q9CQL6 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Mrpl35Q9CQL6 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mrpl35Q9CQL6 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Mrpl35Q9CQL6 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Mrpl35Q9CQL6 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mrpl35Q9CQL6 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mrpl35Q9CQL6 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mrpl35Q9CQL6 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms