Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA1

Trappc5, Trafficking protein particle complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc5Q9CQA1 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc5Q9CQA1 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc5Q9CQA1 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc5Q9CQA1 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc5Q9CQA1 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc5Q9CQA1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc5Q9CQA1 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc5Q9CQA1 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc5Q9CQA1 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc5Q9CQA1 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc5Q9CQA1 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc5Q9CQA1 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc5Q9CQA1 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc5Q9CQA1 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc5Q9CQA1 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc5Q9CQA1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc5Q9CQA1 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc5Q9CQA1 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc5Q9CQA1 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc5Q9CQA1 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc5Q9CQA1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc5Q9CQA1 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc5Q9CQA1 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc5Q9CQA1 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc5Q9CQA1 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc5Q9CQA1 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc5Q9CQA1 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc5Q9CQA1 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc5Q9CQA1 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc5Q9CQA1 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc5Q9CQA1 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc5Q9CQA1 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc5Q9CQA1 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc5Q9CQA1 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc5Q9CQA1 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc5Q9CQA1 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc5Q9CQA1 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc5Q9CQA1 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc5Q9CQA1 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc5Q9CQA1 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc5Q9CQA1 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc5Q9CQA1 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc5Q9CQA1 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc5Q9CQA1 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc5Q9CQA1 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc5Q9CQA1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc5Q9CQA1 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc5Q9CQA1 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc5Q9CQA1 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc5Q9CQA1 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc5Q9CQA1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc5Q9CQA1 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc5Q9CQA1 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc5Q9CQA1 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc5Q9CQA1 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc5Q9CQA1 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc5Q9CQA1 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trappc5Q9CQA1 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trappc5Q9CQA1 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trappc5Q9CQA1 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trappc5Q9CQA1 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trappc5Q9CQA1 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms