Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpa3Q9CQ71 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms