Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnaseh2cQ9CQ18 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms