Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR7

Sike1, Suppressor of IKBKE 1, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sike1Q9CPR7 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sike1Q9CPR7 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sike1Q9CPR7 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sike1Q9CPR7 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sike1Q9CPR7 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sike1Q9CPR7 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sike1Q9CPR7 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sike1Q9CPR7 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sike1Q9CPR7 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sike1Q9CPR7 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sike1Q9CPR7 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sike1Q9CPR7 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sike1Q9CPR7 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sike1Q9CPR7 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sike1Q9CPR7 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sike1Q9CPR7 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sike1Q9CPR7 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sike1Q9CPR7 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sike1Q9CPR7 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sike1Q9CPR7 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sike1Q9CPR7 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sike1Q9CPR7 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sike1Q9CPR7 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sike1Q9CPR7 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sike1Q9CPR7 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sike1Q9CPR7 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sike1Q9CPR7 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sike1Q9CPR7 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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