Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR6

Krt88, Keratin 88, mousemouse

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Length 171 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt88Q9CPR6 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Krt88Q9CPR6 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Krt88Q9CPR6 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Krt88Q9CPR6 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Krt88Q9CPR6 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Krt88Q9CPR6 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Krt88Q9CPR6 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Krt88Q9CPR6 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt88Q9CPR6 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt88Q9CPR6 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt88Q9CPR6 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt88Q9CPR6 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt88Q9CPR6 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt88Q9CPR6 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt88Q9CPR6 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt88Q9CPR6 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt88Q9CPR6 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt88Q9CPR6 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt88Q9CPR6 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt88Q9CPR6 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt88Q9CPR6 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt88Q9CPR6 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt88Q9CPR6 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt88Q9CPR6 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt88Q9CPR6 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt88Q9CPR6 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt88Q9CPR6 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt88Q9CPR6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt88Q9CPR6 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt88Q9CPR6 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt88Q9CPR6 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt88Q9CPR6 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt88Q9CPR6 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt88Q9CPR6 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt88Q9CPR6 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt88Q9CPR6 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt88Q9CPR6 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt88Q9CPR6 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt88Q9CPR6 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt88Q9CPR6 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt88Q9CPR6 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt88Q9CPR6 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt88Q9CPR6 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt88Q9CPR6 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt88Q9CPR6 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt88Q9CPR6 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt88Q9CPR6 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt88Q9CPR6 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt88Q9CPR6 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt88Q9CPR6 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt88Q9CPR6 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt88Q9CPR6 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt88Q9CPR6 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt88Q9CPR6 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt88Q9CPR6 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt88Q9CPR6 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt88Q9CPR6 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt88Q9CPR6 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt88Q9CPR6 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt88Q9CPR6 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt88Q9CPR6 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Krt88Q9CPR6 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Krt88Q9CPR6 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Krt88Q9CPR6 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt88Q9CPR6 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt88Q9CPR6 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt88Q9CPR6 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt88Q9CPR6 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt88Q9CPR6 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt88Q9CPR6 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt88Q9CPR6 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt88Q9CPR6 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt88Q9CPR6 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt88Q9CPR6 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt88Q9CPR6 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt88Q9CPR6 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt88Q9CPR6 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt88Q9CPR6 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt88Q9CPR6 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt88Q9CPR6 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt88Q9CPR6 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt88Q9CPR6 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt88Q9CPR6 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt88Q9CPR6 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt88Q9CPR6 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt88Q9CPR6 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt88Q9CPR6 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt88Q9CPR6 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt88Q9CPR6 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt88Q9CPR6 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt88Q9CPR6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt88Q9CPR6 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt88Q9CPR6 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt88Q9CPR6 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt88Q9CPR6 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt88Q9CPR6 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt88Q9CPR6 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt88Q9CPR6 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt88Q9CPR6 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt88Q9CPR6 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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