Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL5

Rrbp1, Ribosome-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrbp1Q99PL5 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Rrbp1Q99PL5 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rrbp1Q99PL5 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rrbp1Q99PL5 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rrbp1Q99PL5 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rrbp1Q99PL5 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rrbp1Q99PL5 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rrbp1Q99PL5 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rrbp1Q99PL5 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rrbp1Q99PL5 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rrbp1Q99PL5 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rrbp1Q99PL5 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rrbp1Q99PL5 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rrbp1Q99PL5 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rrbp1Q99PL5 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rrbp1Q99PL5 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rrbp1Q99PL5 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rrbp1Q99PL5 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rrbp1Q99PL5 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rrbp1Q99PL5 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rrbp1Q99PL5 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rrbp1Q99PL5 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rrbp1Q99PL5 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rrbp1Q99PL5 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rrbp1Q99PL5 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rrbp1Q99PL5 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rrbp1Q99PL5 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rrbp1Q99PL5 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rrbp1Q99PL5 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rrbp1Q99PL5 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rrbp1Q99PL5 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rrbp1Q99PL5 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rrbp1Q99PL5 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rrbp1Q99PL5 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rrbp1Q99PL5 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rrbp1Q99PL5 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rrbp1Q99PL5 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rrbp1Q99PL5 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rrbp1Q99PL5 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rrbp1Q99PL5 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rrbp1Q99PL5 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rrbp1Q99PL5 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rrbp1Q99PL5 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rrbp1Q99PL5 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rrbp1Q99PL5 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rrbp1Q99PL5 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rrbp1Q99PL5 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rrbp1Q99PL5 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rrbp1Q99PL5 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rrbp1Q99PL5 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rrbp1Q99PL5 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rrbp1Q99PL5 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rrbp1Q99PL5 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rrbp1Q99PL5 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rrbp1Q99PL5 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rrbp1Q99PL5 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rrbp1Q99PL5 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rrbp1Q99PL5 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rrbp1Q99PL5 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rrbp1Q99PL5 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rrbp1Q99PL5 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rrbp1Q99PL5 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rrbp1Q99PL5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rrbp1Q99PL5 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rrbp1Q99PL5 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rrbp1Q99PL5 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rrbp1Q99PL5 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rrbp1Q99PL5 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rrbp1Q99PL5 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rrbp1Q99PL5 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rrbp1Q99PL5 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rrbp1Q99PL5 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rrbp1Q99PL5 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rrbp1Q99PL5 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rrbp1Q99PL5 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rrbp1Q99PL5 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms