Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim3Q99PE5 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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