Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nup155Q99P88 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nup155Q99P88 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nup155Q99P88 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Nup155Q99P88 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nup155Q99P88 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nup155Q99P88 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nup155Q99P88 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nup155Q99P88 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nup155Q99P88 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nup155Q99P88 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nup155Q99P88 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nup155Q99P88 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nup155Q99P88 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nup155Q99P88 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nup155Q99P88 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nup155Q99P88 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nup155Q99P88 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nup155Q99P88 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nup155Q99P88 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nup155Q99P88 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Nup155Q99P88 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nup155Q99P88 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nup155Q99P88 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Nup155Q99P88 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nup155Q99P88 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nup155Q99P88 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Nup155Q99P88 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Nup155Q99P88 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Nup155Q99P88 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nup155Q99P88 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nup155Q99P88 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nup155Q99P88 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nup155Q99P88 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nup155Q99P88 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nup155Q99P88 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nup155Q99P88 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Nup155Q99P88 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nup155Q99P88 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nup155Q99P88 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nup155Q99P88 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nup155Q99P88 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nup155Q99P88 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nup155Q99P88 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nup155Q99P88 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nup155Q99P88 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nup155Q99P88 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nup155Q99P88 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nup155Q99P88 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Nup155Q99P88 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nup155Q99P88 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Nup155Q99P88 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nup155Q99P88 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nup155Q99P88 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nup155Q99P88 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nup155Q99P88 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nup155Q99P88 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nup155Q99P88 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Nup155Q99P88 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Nup155Q99P88 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nup155Q99P88 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nup155Q99P88 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nup155Q99P88 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nup155Q99P88 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nup155Q99P88 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Nup155Q99P88 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nup155Q99P88 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nup155Q99P88 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Nup155Q99P88 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nup155Q99P88 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nup155Q99P88 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nup155Q99P88 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nup155Q99P88 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nup155Q99P88 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nup155Q99P88 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nup155Q99P88 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nup155Q99P88 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nup155Q99P88 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Nup155Q99P88 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nup155Q99P88 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nup155Q99P88 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nup155Q99P88 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nup155Q99P88 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nup155Q99P88 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Nup155Q99P88 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nup155Q99P88 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nup155Q99P88 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Nup155Q99P88 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nup155Q99P88 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Nup155Q99P88 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nup155Q99P88 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nup155Q99P88 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Nup155Q99P88 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nup155Q99P88 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nup155Q99P88 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nup155Q99P88 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nup155Q99P88 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nup155Q99P88 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nup155Q99P88 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nup155Q99P88 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms