Protein–RNA interactions for Protein: Q99P87

Retn, Resistin, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RetnQ99P87 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RetnQ99P87 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RetnQ99P87 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RetnQ99P87 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RetnQ99P87 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RetnQ99P87 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RetnQ99P87 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RetnQ99P87 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RetnQ99P87 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RetnQ99P87 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RetnQ99P87 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RetnQ99P87 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RetnQ99P87 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RetnQ99P87 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RetnQ99P87 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
RetnQ99P87 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RetnQ99P87 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
RetnQ99P87 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
RetnQ99P87 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
RetnQ99P87 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
RetnQ99P87 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
RetnQ99P87 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
RetnQ99P87 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
RetnQ99P87 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RetnQ99P87 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RetnQ99P87 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RetnQ99P87 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RetnQ99P87 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RetnQ99P87 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RetnQ99P87 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RetnQ99P87 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RetnQ99P87 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RetnQ99P87 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RetnQ99P87 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RetnQ99P87 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
RetnQ99P87 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RetnQ99P87 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RetnQ99P87 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RetnQ99P87 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RetnQ99P87 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RetnQ99P87 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RetnQ99P87 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RetnQ99P87 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RetnQ99P87 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RetnQ99P87 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RetnQ99P87 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RetnQ99P87 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RetnQ99P87 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RetnQ99P87 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RetnQ99P87 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RetnQ99P87 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RetnQ99P87 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RetnQ99P87 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RetnQ99P87 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RetnQ99P87 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RetnQ99P87 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RetnQ99P87 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RetnQ99P87 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RetnQ99P87 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RetnQ99P87 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RetnQ99P87 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RetnQ99P87 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RetnQ99P87 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RetnQ99P87 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RetnQ99P87 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RetnQ99P87 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RetnQ99P87 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RetnQ99P87 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RetnQ99P87 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RetnQ99P87 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RetnQ99P87 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RetnQ99P87 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RetnQ99P87 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RetnQ99P87 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RetnQ99P87 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RetnQ99P87 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RetnQ99P87 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RetnQ99P87 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RetnQ99P87 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RetnQ99P87 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RetnQ99P87 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RetnQ99P87 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RetnQ99P87 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RetnQ99P87 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RetnQ99P87 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RetnQ99P87 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RetnQ99P87 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RetnQ99P87 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RetnQ99P87 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RetnQ99P87 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RetnQ99P87 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RetnQ99P87 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
RetnQ99P87 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RetnQ99P87 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RetnQ99P87 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
RetnQ99P87 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RetnQ99P87 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RetnQ99P87 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RetnQ99P87 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RetnQ99P87 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms