Protein–RNA interactions for Protein: Q99N96

Mrpl1, 39S ribosomal protein L1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl1Q99N96 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl1Q99N96 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl1Q99N96 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl1Q99N96 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl1Q99N96 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl1Q99N96 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl1Q99N96 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl1Q99N96 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl1Q99N96 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl1Q99N96 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl1Q99N96 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl1Q99N96 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl1Q99N96 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl1Q99N96 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl1Q99N96 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl1Q99N96 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl1Q99N96 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl1Q99N96 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl1Q99N96 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl1Q99N96 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl1Q99N96 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl1Q99N96 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl1Q99N96 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl1Q99N96 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl1Q99N96 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl1Q99N96 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl1Q99N96 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl1Q99N96 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl1Q99N96 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl1Q99N96 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl1Q99N96 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl1Q99N96 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl1Q99N96 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl1Q99N96 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl1Q99N96 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl1Q99N96 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl1Q99N96 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl1Q99N96 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl1Q99N96 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl1Q99N96 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl1Q99N96 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl1Q99N96 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl1Q99N96 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl1Q99N96 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl1Q99N96 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl1Q99N96 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl1Q99N96 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl1Q99N96 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl1Q99N96 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl1Q99N96 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl1Q99N96 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl1Q99N96 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl1Q99N96 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl1Q99N96 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl1Q99N96 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl1Q99N96 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl1Q99N96 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl1Q99N96 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl1Q99N96 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl1Q99N96 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl1Q99N96 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl1Q99N96 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl1Q99N96 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl1Q99N96 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl1Q99N96 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl1Q99N96 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl1Q99N96 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl1Q99N96 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl1Q99N96 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl1Q99N96 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl1Q99N96 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl1Q99N96 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl1Q99N96 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl1Q99N96 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl1Q99N96 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl1Q99N96 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl1Q99N96 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl1Q99N96 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl1Q99N96 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl1Q99N96 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl1Q99N96 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl1Q99N96 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl1Q99N96 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl1Q99N96 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl1Q99N96 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl1Q99N96 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl1Q99N96 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl1Q99N96 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl1Q99N96 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl1Q99N96 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl1Q99N96 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl1Q99N96 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl1Q99N96 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl1Q99N96 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl1Q99N96 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Mrpl1Q99N96 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Mrpl1Q99N96 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Mrpl1Q99N96 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mrpl1Q99N96 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mrpl1Q99N96 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms