Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gps1Q99LD4 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gps1Q99LD4 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gps1Q99LD4 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gps1Q99LD4 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gps1Q99LD4 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gps1Q99LD4 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gps1Q99LD4 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gps1Q99LD4 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gps1Q99LD4 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gps1Q99LD4 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gps1Q99LD4 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gps1Q99LD4 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gps1Q99LD4 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gps1Q99LD4 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gps1Q99LD4 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gps1Q99LD4 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gps1Q99LD4 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gps1Q99LD4 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gps1Q99LD4 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gps1Q99LD4 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gps1Q99LD4 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gps1Q99LD4 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gps1Q99LD4 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gps1Q99LD4 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gps1Q99LD4 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gps1Q99LD4 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gps1Q99LD4 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gps1Q99LD4 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gps1Q99LD4 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gps1Q99LD4 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gps1Q99LD4 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gps1Q99LD4 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gps1Q99LD4 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gps1Q99LD4 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gps1Q99LD4 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gps1Q99LD4 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gps1Q99LD4 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gps1Q99LD4 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gps1Q99LD4 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gps1Q99LD4 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gps1Q99LD4 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gps1Q99LD4 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gps1Q99LD4 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gps1Q99LD4 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gps1Q99LD4 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gps1Q99LD4 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gps1Q99LD4 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gps1Q99LD4 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gps1Q99LD4 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gps1Q99LD4 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gps1Q99LD4 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gps1Q99LD4 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gps1Q99LD4 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gps1Q99LD4 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gps1Q99LD4 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gps1Q99LD4 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gps1Q99LD4 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gps1Q99LD4 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gps1Q99LD4 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gps1Q99LD4 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gps1Q99LD4 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gps1Q99LD4 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gps1Q99LD4 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gps1Q99LD4 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gps1Q99LD4 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gps1Q99LD4 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gps1Q99LD4 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gps1Q99LD4 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gps1Q99LD4 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gps1Q99LD4 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gps1Q99LD4 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms