Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ciao1Q99KN2 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms