Protein–RNA interactions for Protein: Q99JH8

Kdelr1, ER lumen protein-retaining receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdelr1Q99JH8 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kdelr1Q99JH8 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kdelr1Q99JH8 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kdelr1Q99JH8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kdelr1Q99JH8 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kdelr1Q99JH8 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kdelr1Q99JH8 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kdelr1Q99JH8 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kdelr1Q99JH8 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kdelr1Q99JH8 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kdelr1Q99JH8 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kdelr1Q99JH8 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kdelr1Q99JH8 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Kdelr1Q99JH8 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kdelr1Q99JH8 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kdelr1Q99JH8 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kdelr1Q99JH8 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Kdelr1Q99JH8 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kdelr1Q99JH8 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kdelr1Q99JH8 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kdelr1Q99JH8 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kdelr1Q99JH8 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kdelr1Q99JH8 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Kdelr1Q99JH8 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kdelr1Q99JH8 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kdelr1Q99JH8 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kdelr1Q99JH8 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kdelr1Q99JH8 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kdelr1Q99JH8 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kdelr1Q99JH8 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Kdelr1Q99JH8 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kdelr1Q99JH8 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kdelr1Q99JH8 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kdelr1Q99JH8 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdelr1Q99JH8 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdelr1Q99JH8 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdelr1Q99JH8 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdelr1Q99JH8 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdelr1Q99JH8 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdelr1Q99JH8 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdelr1Q99JH8 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdelr1Q99JH8 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdelr1Q99JH8 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdelr1Q99JH8 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdelr1Q99JH8 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdelr1Q99JH8 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdelr1Q99JH8 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdelr1Q99JH8 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdelr1Q99JH8 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdelr1Q99JH8 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdelr1Q99JH8 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdelr1Q99JH8 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdelr1Q99JH8 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdelr1Q99JH8 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdelr1Q99JH8 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdelr1Q99JH8 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdelr1Q99JH8 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdelr1Q99JH8 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdelr1Q99JH8 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdelr1Q99JH8 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdelr1Q99JH8 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdelr1Q99JH8 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdelr1Q99JH8 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdelr1Q99JH8 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdelr1Q99JH8 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdelr1Q99JH8 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdelr1Q99JH8 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdelr1Q99JH8 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdelr1Q99JH8 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdelr1Q99JH8 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdelr1Q99JH8 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdelr1Q99JH8 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdelr1Q99JH8 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdelr1Q99JH8 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdelr1Q99JH8 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdelr1Q99JH8 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdelr1Q99JH8 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdelr1Q99JH8 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdelr1Q99JH8 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdelr1Q99JH8 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdelr1Q99JH8 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdelr1Q99JH8 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdelr1Q99JH8 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdelr1Q99JH8 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdelr1Q99JH8 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdelr1Q99JH8 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdelr1Q99JH8 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdelr1Q99JH8 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdelr1Q99JH8 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdelr1Q99JH8 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdelr1Q99JH8 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdelr1Q99JH8 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdelr1Q99JH8 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdelr1Q99JH8 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdelr1Q99JH8 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdelr1Q99JH8 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdelr1Q99JH8 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdelr1Q99JH8 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdelr1Q99JH8 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdelr1Q99JH8 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms