Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms