Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf144aQ925F3 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf144aQ925F3 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf144aQ925F3 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf144aQ925F3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf144aQ925F3 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf144aQ925F3 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf144aQ925F3 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf144aQ925F3 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf144aQ925F3 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf144aQ925F3 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf144aQ925F3 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf144aQ925F3 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf144aQ925F3 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf144aQ925F3 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf144aQ925F3 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf144aQ925F3 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf144aQ925F3 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf144aQ925F3 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf144aQ925F3 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf144aQ925F3 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf144aQ925F3 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf144aQ925F3 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf144aQ925F3 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf144aQ925F3 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf144aQ925F3 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf144aQ925F3 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf144aQ925F3 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf144aQ925F3 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf144aQ925F3 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf144aQ925F3 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf144aQ925F3 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf144aQ925F3 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf144aQ925F3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf144aQ925F3 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf144aQ925F3 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf144aQ925F3 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf144aQ925F3 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf144aQ925F3 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf144aQ925F3 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf144aQ925F3 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf144aQ925F3 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf144aQ925F3 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf144aQ925F3 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf144aQ925F3 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf144aQ925F3 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf144aQ925F3 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf144aQ925F3 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf144aQ925F3 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf144aQ925F3 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf144aQ925F3 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf144aQ925F3 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf144aQ925F3 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf144aQ925F3 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf144aQ925F3 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf144aQ925F3 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf144aQ925F3 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf144aQ925F3 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf144aQ925F3 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf144aQ925F3 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnf144aQ925F3 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnf144aQ925F3 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnf144aQ925F3 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnf144aQ925F3 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnf144aQ925F3 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnf144aQ925F3 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnf144aQ925F3 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnf144aQ925F3 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnf144aQ925F3 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnf144aQ925F3 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnf144aQ925F3 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnf144aQ925F3 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnf144aQ925F3 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnf144aQ925F3 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnf144aQ925F3 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
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