Protein–RNA interactions for Protein: Q920N1

Odf3, Outer dense fiber protein 3, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3Q920N1 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Odf3Q920N1 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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