Protein–RNA interactions for Protein: Q91YD4

Trpm2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm2Q91YD4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpm2Q91YD4 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpm2Q91YD4 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpm2Q91YD4 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpm2Q91YD4 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpm2Q91YD4 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpm2Q91YD4 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpm2Q91YD4 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpm2Q91YD4 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpm2Q91YD4 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpm2Q91YD4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpm2Q91YD4 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpm2Q91YD4 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpm2Q91YD4 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpm2Q91YD4 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpm2Q91YD4 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpm2Q91YD4 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpm2Q91YD4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trpm2Q91YD4 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trpm2Q91YD4 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trpm2Q91YD4 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trpm2Q91YD4 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trpm2Q91YD4 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Trpm2Q91YD4 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trpm2Q91YD4 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trpm2Q91YD4 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trpm2Q91YD4 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trpm2Q91YD4 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trpm2Q91YD4 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Trpm2Q91YD4 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trpm2Q91YD4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trpm2Q91YD4 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trpm2Q91YD4 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trpm2Q91YD4 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trpm2Q91YD4 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trpm2Q91YD4 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trpm2Q91YD4 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trpm2Q91YD4 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trpm2Q91YD4 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trpm2Q91YD4 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trpm2Q91YD4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trpm2Q91YD4 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trpm2Q91YD4 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trpm2Q91YD4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trpm2Q91YD4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trpm2Q91YD4 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trpm2Q91YD4 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trpm2Q91YD4 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trpm2Q91YD4 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trpm2Q91YD4 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trpm2Q91YD4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trpm2Q91YD4 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trpm2Q91YD4 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Trpm2Q91YD4 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trpm2Q91YD4 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trpm2Q91YD4 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trpm2Q91YD4 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trpm2Q91YD4 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpm2Q91YD4 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpm2Q91YD4 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpm2Q91YD4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpm2Q91YD4 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpm2Q91YD4 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpm2Q91YD4 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpm2Q91YD4 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpm2Q91YD4 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpm2Q91YD4 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpm2Q91YD4 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpm2Q91YD4 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpm2Q91YD4 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpm2Q91YD4 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpm2Q91YD4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpm2Q91YD4 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpm2Q91YD4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpm2Q91YD4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpm2Q91YD4 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpm2Q91YD4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpm2Q91YD4 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpm2Q91YD4 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpm2Q91YD4 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trpm2Q91YD4 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trpm2Q91YD4 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trpm2Q91YD4 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trpm2Q91YD4 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Trpm2Q91YD4 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trpm2Q91YD4 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Trpm2Q91YD4 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trpm2Q91YD4 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trpm2Q91YD4 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trpm2Q91YD4 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trpm2Q91YD4 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trpm2Q91YD4 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trpm2Q91YD4 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trpm2Q91YD4 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Trpm2Q91YD4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpm2Q91YD4 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpm2Q91YD4 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpm2Q91YD4 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpm2Q91YD4 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpm2Q91YD4 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms