Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC66

Ssx2ip, Afadin- and alpha-actinin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx2ipQ8VC66 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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