Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC51

Wrap53, Telomerase Cajal body protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wrap53Q8VC51 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Wrap53Q8VC51 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Wrap53Q8VC51 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Wrap53Q8VC51 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Wrap53Q8VC51 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Wrap53Q8VC51 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Wrap53Q8VC51 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Wrap53Q8VC51 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Wrap53Q8VC51 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Wrap53Q8VC51 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Wrap53Q8VC51 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Wrap53Q8VC51 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Wrap53Q8VC51 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Wrap53Q8VC51 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Wrap53Q8VC51 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Wrap53Q8VC51 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Wrap53Q8VC51 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Wrap53Q8VC51 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Wrap53Q8VC51 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Wrap53Q8VC51 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Wrap53Q8VC51 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Wrap53Q8VC51 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Wrap53Q8VC51 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Wrap53Q8VC51 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Wrap53Q8VC51 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Wrap53Q8VC51 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Wrap53Q8VC51 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Wrap53Q8VC51 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Wrap53Q8VC51 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Wrap53Q8VC51 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Wrap53Q8VC51 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Wrap53Q8VC51 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Wrap53Q8VC51 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Wrap53Q8VC51 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Wrap53Q8VC51 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Wrap53Q8VC51 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Wrap53Q8VC51 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Wrap53Q8VC51 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Wrap53Q8VC51 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Wrap53Q8VC51 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Wrap53Q8VC51 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Wrap53Q8VC51 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Wrap53Q8VC51 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Wrap53Q8VC51 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Wrap53Q8VC51 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Wrap53Q8VC51 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Wrap53Q8VC51 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Wrap53Q8VC51 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Wrap53Q8VC51 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Wrap53Q8VC51 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Wrap53Q8VC51 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Wrap53Q8VC51 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Wrap53Q8VC51 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Wrap53Q8VC51 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Wrap53Q8VC51 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Wrap53Q8VC51 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Wrap53Q8VC51 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Wrap53Q8VC51 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Wrap53Q8VC51 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Wrap53Q8VC51 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Wrap53Q8VC51 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Wrap53Q8VC51 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Wrap53Q8VC51 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Wrap53Q8VC51 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Wrap53Q8VC51 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Wrap53Q8VC51 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Wrap53Q8VC51 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wrap53Q8VC51 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wrap53Q8VC51 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Wrap53Q8VC51 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wrap53Q8VC51 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wrap53Q8VC51 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wrap53Q8VC51 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wrap53Q8VC51 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wrap53Q8VC51 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wrap53Q8VC51 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wrap53Q8VC51 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wrap53Q8VC51 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wrap53Q8VC51 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wrap53Q8VC51 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wrap53Q8VC51 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wrap53Q8VC51 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wrap53Q8VC51 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wrap53Q8VC51 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wrap53Q8VC51 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wrap53Q8VC51 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Wrap53Q8VC51 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Wrap53Q8VC51 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wrap53Q8VC51 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Wrap53Q8VC51 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wrap53Q8VC51 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wrap53Q8VC51 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wrap53Q8VC51 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wrap53Q8VC51 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wrap53Q8VC51 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wrap53Q8VC51 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wrap53Q8VC51 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wrap53Q8VC51 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Wrap53Q8VC51 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Wrap53Q8VC51 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms