Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC33

Nxnl1, Nucleoredoxin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxnl1Q8VC33 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nxnl1Q8VC33 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nxnl1Q8VC33 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nxnl1Q8VC33 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nxnl1Q8VC33 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nxnl1Q8VC33 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nxnl1Q8VC33 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nxnl1Q8VC33 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nxnl1Q8VC33 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nxnl1Q8VC33 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nxnl1Q8VC33 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nxnl1Q8VC33 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nxnl1Q8VC33 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nxnl1Q8VC33 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nxnl1Q8VC33 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nxnl1Q8VC33 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nxnl1Q8VC33 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nxnl1Q8VC33 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nxnl1Q8VC33 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nxnl1Q8VC33 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nxnl1Q8VC33 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nxnl1Q8VC33 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nxnl1Q8VC33 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nxnl1Q8VC33 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nxnl1Q8VC33 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nxnl1Q8VC33 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nxnl1Q8VC33 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nxnl1Q8VC33 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nxnl1Q8VC33 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nxnl1Q8VC33 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nxnl1Q8VC33 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nxnl1Q8VC33 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nxnl1Q8VC33 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Nxnl1Q8VC33 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nxnl1Q8VC33 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nxnl1Q8VC33 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nxnl1Q8VC33 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nxnl1Q8VC33 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nxnl1Q8VC33 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nxnl1Q8VC33 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nxnl1Q8VC33 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nxnl1Q8VC33 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nxnl1Q8VC33 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nxnl1Q8VC33 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nxnl1Q8VC33 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nxnl1Q8VC33 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nxnl1Q8VC33 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nxnl1Q8VC33 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nxnl1Q8VC33 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nxnl1Q8VC33 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nxnl1Q8VC33 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nxnl1Q8VC33 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nxnl1Q8VC33 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nxnl1Q8VC33 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nxnl1Q8VC33 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nxnl1Q8VC33 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nxnl1Q8VC33 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nxnl1Q8VC33 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nxnl1Q8VC33 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nxnl1Q8VC33 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nxnl1Q8VC33 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nxnl1Q8VC33 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nxnl1Q8VC33 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nxnl1Q8VC33 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nxnl1Q8VC33 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nxnl1Q8VC33 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nxnl1Q8VC33 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nxnl1Q8VC33 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nxnl1Q8VC33 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nxnl1Q8VC33 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nxnl1Q8VC33 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nxnl1Q8VC33 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nxnl1Q8VC33 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nxnl1Q8VC33 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nxnl1Q8VC33 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nxnl1Q8VC33 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nxnl1Q8VC33 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nxnl1Q8VC33 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nxnl1Q8VC33 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nxnl1Q8VC33 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nxnl1Q8VC33 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nxnl1Q8VC33 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nxnl1Q8VC33 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nxnl1Q8VC33 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nxnl1Q8VC33 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nxnl1Q8VC33 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nxnl1Q8VC33 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nxnl1Q8VC33 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nxnl1Q8VC33 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nxnl1Q8VC33 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nxnl1Q8VC33 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nxnl1Q8VC33 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nxnl1Q8VC33 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nxnl1Q8VC33 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nxnl1Q8VC33 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nxnl1Q8VC33 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nxnl1Q8VC33 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nxnl1Q8VC33 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nxnl1Q8VC33 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nxnl1Q8VC33 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms