Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT0

Tmx1, Thioredoxin-related transmembrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmx1Q8VBT0 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmx1Q8VBT0 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmx1Q8VBT0 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmx1Q8VBT0 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmx1Q8VBT0 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmx1Q8VBT0 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmx1Q8VBT0 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmx1Q8VBT0 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmx1Q8VBT0 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmx1Q8VBT0 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmx1Q8VBT0 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmx1Q8VBT0 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmx1Q8VBT0 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmx1Q8VBT0 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmx1Q8VBT0 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmx1Q8VBT0 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmx1Q8VBT0 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmx1Q8VBT0 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmx1Q8VBT0 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmx1Q8VBT0 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmx1Q8VBT0 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmx1Q8VBT0 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmx1Q8VBT0 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmx1Q8VBT0 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmx1Q8VBT0 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmx1Q8VBT0 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmx1Q8VBT0 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmx1Q8VBT0 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmx1Q8VBT0 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmx1Q8VBT0 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmx1Q8VBT0 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmx1Q8VBT0 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmx1Q8VBT0 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmx1Q8VBT0 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmx1Q8VBT0 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmx1Q8VBT0 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmx1Q8VBT0 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmx1Q8VBT0 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tmx1Q8VBT0 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmx1Q8VBT0 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmx1Q8VBT0 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmx1Q8VBT0 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmx1Q8VBT0 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmx1Q8VBT0 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmx1Q8VBT0 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmx1Q8VBT0 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmx1Q8VBT0 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmx1Q8VBT0 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmx1Q8VBT0 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmx1Q8VBT0 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmx1Q8VBT0 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmx1Q8VBT0 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmx1Q8VBT0 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmx1Q8VBT0 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmx1Q8VBT0 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmx1Q8VBT0 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmx1Q8VBT0 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmx1Q8VBT0 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmx1Q8VBT0 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmx1Q8VBT0 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmx1Q8VBT0 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmx1Q8VBT0 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmx1Q8VBT0 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmx1Q8VBT0 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmx1Q8VBT0 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmx1Q8VBT0 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmx1Q8VBT0 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmx1Q8VBT0 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmx1Q8VBT0 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmx1Q8VBT0 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmx1Q8VBT0 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmx1Q8VBT0 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmx1Q8VBT0 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmx1Q8VBT0 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmx1Q8VBT0 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmx1Q8VBT0 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmx1Q8VBT0 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmx1Q8VBT0 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmx1Q8VBT0 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmx1Q8VBT0 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmx1Q8VBT0 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmx1Q8VBT0 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmx1Q8VBT0 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmx1Q8VBT0 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmx1Q8VBT0 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmx1Q8VBT0 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmx1Q8VBT0 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmx1Q8VBT0 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmx1Q8VBT0 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmx1Q8VBT0 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmx1Q8VBT0 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmx1Q8VBT0 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmx1Q8VBT0 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmx1Q8VBT0 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmx1Q8VBT0 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmx1Q8VBT0 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmx1Q8VBT0 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmx1Q8VBT0 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmx1Q8VBT0 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmx1Q8VBT0 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms