Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Ccdc58Q8R3Q6 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Ccdc58Q8R3Q6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Ccdc58Q8R3Q6 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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