Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y9

Ccm2, Cerebral cavernous malformations protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccm2Q8K2Y9 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccm2Q8K2Y9 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccm2Q8K2Y9 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccm2Q8K2Y9 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccm2Q8K2Y9 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccm2Q8K2Y9 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccm2Q8K2Y9 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccm2Q8K2Y9 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccm2Q8K2Y9 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms