Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nek9Q8K1R7 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nek9Q8K1R7 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nek9Q8K1R7 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
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Nek9Q8K1R7 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nek9Q8K1R7 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
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Nek9Q8K1R7 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nek9Q8K1R7 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nek9Q8K1R7 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nek9Q8K1R7 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nek9Q8K1R7 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nek9Q8K1R7 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nek9Q8K1R7 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nek9Q8K1R7 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nek9Q8K1R7 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nek9Q8K1R7 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nek9Q8K1R7 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nek9Q8K1R7 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nek9Q8K1R7 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nek9Q8K1R7 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nek9Q8K1R7 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nek9Q8K1R7 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nek9Q8K1R7 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nek9Q8K1R7 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nek9Q8K1R7 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nek9Q8K1R7 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Nek9Q8K1R7 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nek9Q8K1R7 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Nek9Q8K1R7 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Nek9Q8K1R7 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nek9Q8K1R7 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nek9Q8K1R7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nek9Q8K1R7 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nek9Q8K1R7 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms