Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
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Cldn34c1Q8K193 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
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