Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZQ2

Afg3l2, AFG3-like protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l2Q8JZQ2 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Afg3l2Q8JZQ2 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Afg3l2Q8JZQ2 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Afg3l2Q8JZQ2 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Afg3l2Q8JZQ2 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Afg3l2Q8JZQ2 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Afg3l2Q8JZQ2 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Afg3l2Q8JZQ2 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Afg3l2Q8JZQ2 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Afg3l2Q8JZQ2 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Afg3l2Q8JZQ2 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Afg3l2Q8JZQ2 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Afg3l2Q8JZQ2 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Afg3l2Q8JZQ2 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Afg3l2Q8JZQ2 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Afg3l2Q8JZQ2 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Afg3l2Q8JZQ2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Afg3l2Q8JZQ2 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Afg3l2Q8JZQ2 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Afg3l2Q8JZQ2 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Afg3l2Q8JZQ2 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Afg3l2Q8JZQ2 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Afg3l2Q8JZQ2 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Afg3l2Q8JZQ2 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Afg3l2Q8JZQ2 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Afg3l2Q8JZQ2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Afg3l2Q8JZQ2 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Afg3l2Q8JZQ2 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Afg3l2Q8JZQ2 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Afg3l2Q8JZQ2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Afg3l2Q8JZQ2 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Afg3l2Q8JZQ2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Afg3l2Q8JZQ2 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Afg3l2Q8JZQ2 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Afg3l2Q8JZQ2 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Afg3l2Q8JZQ2 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Afg3l2Q8JZQ2 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Afg3l2Q8JZQ2 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Afg3l2Q8JZQ2 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Afg3l2Q8JZQ2 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Afg3l2Q8JZQ2 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Afg3l2Q8JZQ2 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Afg3l2Q8JZQ2 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Afg3l2Q8JZQ2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Afg3l2Q8JZQ2 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Afg3l2Q8JZQ2 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Afg3l2Q8JZQ2 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Afg3l2Q8JZQ2 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Afg3l2Q8JZQ2 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
Afg3l2Q8JZQ2 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms