Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZL7

Rasgef1b, Ras-GEF domain-containing family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1bQ8JZL7 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rasgef1bQ8JZL7 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rasgef1bQ8JZL7 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rasgef1bQ8JZL7 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rasgef1bQ8JZL7 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Rasgef1bQ8JZL7 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Rasgef1bQ8JZL7 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Rasgef1bQ8JZL7 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rasgef1bQ8JZL7 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Rasgef1bQ8JZL7 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rasgef1bQ8JZL7 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Rasgef1bQ8JZL7 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Rasgef1bQ8JZL7 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rasgef1bQ8JZL7 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Rasgef1bQ8JZL7 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rasgef1bQ8JZL7 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rasgef1bQ8JZL7 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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