Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trip10Q8CJ53 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms