Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LgsnQ8CIX8 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms